Dos muescas en el conector de una tarjeta de video AGP indican que soporta dos tipos de voltaje, 3.3V y 1.5V. Si este es el caso de su tarjeta y el puerto AGP tiene una clavija de codificación, entonces hay una buena posibilidad de que funcione.
Como vi en este enlace, una Nvidia 6200 AGP versión 3.0 8x (2 muescas), funciona en una placa base bh6 que entrega un voltaje de suministro de 3.3V en su puerto AGP 1.0 1x-2x. Esta misma tarjeta se probó primero (varias veces) en otra tarjeta Abit con puerto AGP 2.0 2x-4x (3.3V y 1.5V) AGP y no funcionó, pero no se dañó. La misma marca, pero las especificaciones de puerto AGP se respetan de forma diferente, porque los mismos chipsets no gestionan su puerto (Intel vs. Via).  
Creo que tu tarjeta funcionará pero siempre hay un riesgo, depende de ti ver si estás listo para tomarla.